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“靶點”難尋國產(chǎn)創(chuàng)新藥很迷惘 什么卡了
2018-05-08 21:28:30來源: 科技日報

iCLIP技術(shù)的發(fā)明,讓人們拋棄精密的觀測儀器,也能確定RNA(核糖核酸)和蛋白質(zhì)在哪個位置“交匯”,甚至可以讀出位點“密碼”。

生物學者習慣將iCLIP這個詞拆解為3部分,i:單點,就像捋著一條繩子,看它上面哪里打了個結(jié),哪里掛了“燈籠”;CL:交聯(lián),通過紫外照射等方法讓細胞內(nèi)RNA和蛋白質(zhì)的關(guān)系好成“老鐵”,扯也扯不斷;IP:沉淀,把“老鐵們”從細胞里“薅”出來,有目的地處理。

iCLIP技術(shù)難,猶如萬千人海中找一個人,要從幾十億個堿基對找到一個或幾個確定的結(jié)合點,精確度可想而知。自2010年該技術(shù)在《細胞》上首發(fā),近幾年已逐漸成為相關(guān)領域論文登上CNS(《細胞》《自然》《科學》)頂級刊物的“標配”實驗技術(shù),國內(nèi)實驗室卻極少有成熟經(jīng)驗。

有文章報道,國外研究團隊已在RNA操控中展開“技術(shù)競賽”,研究論文以幾個月為周期輪番在CNS上演。越來越多證據(jù)顯示,非編碼RNA同樣控制著生命活動,RNA上大量未被發(fā)現(xiàn)的作用位點,可能是創(chuàng)新藥的潛在靶點,iCLIP是發(fā)現(xiàn)潛在靶點的“利器”之一。

條件摸索耗時耗力耗感情

“條件的摸索純粹是體力活。”一位熟悉該技術(shù)的研究人員表示,雖然實驗技術(shù)無需購買、不受專利限制、能夠從期刊文獻中學來,但從國外期刊中檢索到的技術(shù)路線完全無法照搬,不同種類細胞(淋巴細胞、巨噬細胞等)需要一整套完全不同的技術(shù)體系。

以IP那部分“免疫共沉淀”為例,要想“薅”對“老鐵”,必須要選擇正確的抗體,進行正確的抗原抗體反應。進行細胞培養(yǎng)、裂解等多步實驗之后,研究人員才能知道抗體對不對,科研團隊通常會從多家公司購買抗體,同時從公司定制,多條腿走路,否則浪費時間和情感。

普遍認為,實驗室如果沒有對某一個蛋白的抗原抗體反應的經(jīng)驗積累,不熟悉幾個靠譜的抗體生產(chǎn)公司,那是不敢貿(mào)然嘗試“薅”這一步的。“很費時間,抗體是特異性的,3—6個月才能生產(chǎn)出來,也很費錢,一小管抗體好幾千元。”該研究人員說。

裂解液濃度、RNA酶的確定完全是基礎化學實驗的方法,“掃蕩式”的排查之后才能夠確定合適的濃度和種類。加“陡”了,很可能什么都得不到,加少了,又會留下很多雜質(zhì),摸索就是在“不漏網(wǎng)一個”和“不錯殺一千”中尋求平衡點。

“RNA比DNA脆弱。”清華大學生命科學院教授楊茂君說,因此對反應條件的控制相當苛刻,容錯度較低。

“摸條件很枯燥,是體力活,要不斷重復,要耐得住寂寞。”一位完成iCLIP實驗流程的研究人員回應,有很多實驗室來交流,也提出要借儀器,還抄走了整個流程,但是全部沒了下文。“這個技術(shù),不下定決心去做,是很難順利地走下來的。”

小小接頭成了CNS論文的“攔路虎”

核酸接頭是整個iCLIP實驗中最核心的關(guān)鍵物質(zhì)之一。它能夠引導DNA(與RNA對應)富集從頭開始,把特定序列變多并被探測到,最終“撈出海面”,這就好比放出個“信號智能追蹤器”,精確匹配、忠誠錨定序列末端是對它的基本要求。

國內(nèi)的方法是設計隨機引物,廣撒薄收,總會撞上某一段。但隨機引物接不上RNA和蛋白質(zhì)結(jié)合的位點,必須特別設計從頭開始的接頭合成對應的DNA鏈,把RNA“拓印”下來,進行測序。

“特別設計”在某些實驗中體現(xiàn)為預腺苷化、磷酸化的處理,但在國內(nèi)買不到此類“接頭”。事實上,在擁有雄厚技術(shù)實力、大量知識產(chǎn)權(quán)的大公司的國家,基因測序公司提供包括接頭合成在內(nèi)的服務,國內(nèi)卻找不到。

“我們之前也沒下決心一定要做iCLIP。”該研究人員說,但是有篇論文投稿了《自然》,審稿人要求完成iCLIP,當時實驗室決定補充其他內(nèi)容改投《細胞》,換了個期刊,審稿人仍然要求完成iCLIP。最終,實驗室不得不從國外買來引物,完成本該是產(chǎn)業(yè)的部分工作,滿足了審稿人的要求。

小試劑,折射化學工業(yè)差距

這不是“小試劑”第一次卡住中國生物產(chǎn)業(yè)的脖子。

多年前,我國某基因測序企業(yè)購買Illumina公司生產(chǎn)的基因測序儀,由于Illumina公司突然對匹配的易耗品“試劑盒”提價,給企業(yè)經(jīng)營造成巨大影響。該企業(yè)最終下定決心砸巨資購買另一家掌握核心技術(shù)的國外制造企業(yè),最終有了中國自己的基因測序儀。

不只接頭,用化學方法在RNA某個核苷酸的第6個位點上,直接連接上一個分子基團,這種“指哪打哪”的精細活,國內(nèi)的生物公司基本還沒涉足。

“這些應用技術(shù)都建立在基礎研究之上。”中美冠科生物技術(shù)公司毛冠平博士認為,理論基礎研究比想象中更重要?;瘜W是生物的基礎,但由于行業(yè)的“老舊”,精密化學合成的底子被扔下了多年,生命科學研究中的多種試劑盒也是國外產(chǎn)品比國內(nèi)產(chǎn)品的口碑好。

“我國的創(chuàng)新藥真要有突破,就要從靶點做起。”中科院院士、四川大學教授魏于全認為,要做創(chuàng)新藥,發(fā)現(xiàn)新靶點的基礎研究必不可少,而這類論文無疑應有實力見諸CNS頂級刊物。

化學藥新藥的藥效原理目前是對體內(nèi)某一關(guān)鍵蛋白質(zhì)作用位點的“鉗制”或者“激活”。拋開后續(xù)的臨床安全評價不談,單從有效性上看,高水平的、能夠精確到作用位點的研究不可或缺。魏于全感到緊迫:“別人把靶點都發(fā)現(xiàn)了,又有技術(shù),怎么可能做不出來新藥。如果用別人的靶點,做出來的藥也很難是新藥。”

無論新藥創(chuàng)制有沒有“新藍海”,仍在于精確位點上的較量。

關(guān)鍵詞: 靶點 國產(chǎn)

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